ＤＮＡ分子は４文字｛Ｔ，Ｃ，Ａ，Ｇ｝のヌクレオチド文字列，タンパク質は２０文字｛Ａ，Ｃ，Ｄ，Ｅ，Ｆ，Ｇ，Ｈ，Ｉ，Ｋ，Ｌ，Ｍ，Ｎ，Ｐ，Ｑ，Ｒ，Ｓ，Ｔ，Ｖ，Ｗ，Ｙ｝のアミノ酸文字列である．

　３つの連続したヌクレオチドｘｙｚが１つのコドンを形成し，ＤＮＡらせんｘ1ｙ1ｚ1ｘ2ｙ2ｚ2・・・がタンパク質ｆ（ｘ1ｙ1ｚ1）ｆ（ｘ2ｙ2ｚ2）・・・を指定する．

　ただし，ｆ（ｘｙｚ）は，行列

行列１＝［ＦＳＹＣ］　　行列２＝［ＬＰＨＲ］

　　　　［ＦＳＹＣ］　　　　　　［ＬＰＨＲ］

　　　　［ＩＳ−−］　　　　　　［ＬＰＱＲ］

　　　　［ＩＳ−Ｗ］　　　　　　［ＬＰＱＲ］

行列３＝［ＩＴＮＳ］　　行列４＝［ＶＡＤＧ］

　　　　［ＩＴＮＳ］　　　　　　［ＶＡＤＧ］

　　　　［ＩＴＫＲ］　　　　　　［ＶＡＥＧ］

　　　　［ＭＴＫＲ］　　　　　　［ＶＡＥＧ］

のｚ行ｙ列に存在する要素である．−はストッパーである．

　このとき，｛Ｔ，Ｃ，Ａ，Ｇ｝＝｛１，２，３，４｝とすると，たとえば，ｆ（ＣＡＴ）は行列１の１行３列の要素，すなわちＨである．コード化はストッパーに行き着くまで進む．

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