ＤＮＡはそれぞれの場所で４つの塩基（Ａ・Ｃ・Ｇ・Ｔ）をもっている．ここでは１０個の塩基配列で考えられるすべての集合（アンサンブル）を考える．その位数は４^10である．このＤＮＡ空間は自然な距離をもつ計量空間になっている．

　たとえば，

　　ＡＡＡＡＡＡＡＡＡＡ

と３つの点突然変異

　　ＡＡＡＡＡＣＡＡＡＡ

　　ＡＡＡＡＡＣＴＡＡＡ

　　ＡＡＧＡＡＣＴＡＡＡ

を考えると，ＡＡＡＡＡＡＡＡＡＡから最も遠いのはＡＡＧＡＡＣＴＡＡＡである．

　１０次元の多面体での位数は２^10−１である．正軸対の場合，１０００００００００から最も遠いのは０００００００００１であるが，正単体の場合，両者は一致するので，一般的に自然な距離構造を定義できるかどうかはわからない．

　　１１１１１１１１１１

　　１１１１１０１１１１

　　１１１１１００１１１

　　１１０１１００１１１

を考えると，１１１１１１１１１１から最も遠いのは１１０１１００１１１であるとは言い切れないのである．

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